Heiko Werner gehört der extrem rechten Szene an. Sein Wechsel von den rechtsradikalen “Bürger in Wut” (Bündnis Deutschland) zur Neonazi-Partei “Die Heimat”, vollzog Heiko Werner im Februar 2024. Seit Mai 2023 sitzt Werner im Bremer Ortsbeirat Vegesack.
Laut Bericht der taz “tauchte bereits 2001 sein Name im Zusammenhang mit polizeilichen Ermittlungen gegen die Rechsrock-Szene in Ostfriesland als Kontakt auf. Im Mai 2018 nimmt Werner an einem Solidaritätsmarsch der gewaltbereiten Neonazi-Szene für die inhaftierte Holocaust-Leugnerin Ursula Haverbeck in Bielefeld teil, wie Fotos belegen. Im Juni 2018 beteiligt sich Werner am sogenannten Tag der deutschen Zukunft von NPD und militanter Kameradschafts-Szene in Goslar“.